Arbeiten mit GAMESS Liste von Input-Files  

COORD=ZMTMPC (MOPAC Z-Matrix)

Solch ein Koordinatensystem erhält man häufig über grafische Eingaben mit Programmen wie HyperChem.

!
! N2O4-Molekuel
!
$CONTRL SCFTYP=RHF MULT=1 RUNTYP=OPTIMIZE COORD=ZMTMPC $END
$SYSTEM TIMLIM=1000 MEMORY=5000000 $END
$BASIS GBASIS=STO NGAUSS=6 $END
$GUESS GUESS=HUCKEL $END
$DATA
N2O4-Molekuel
C1
N  0.0000 0   000.0000 0   000.0000 0   0 0 0
N  1.8118 1   000.0000 0   000.0000 0   1 0 0
O  1.1718 1   114.0853 1   000.0000 0   1 2 0
O  1.1719 1   114.0875 1   179.9999 1   1 2 3
O  1.1719 1   114.1060 1   000.0000 1   2 1 3
O  1.1719 1   114.0973 1   179.9999 1   2 1 3
$END
Das erste Stickstoffatom bildet den Startpunkt. Das zweite N ist mit dem ersten durch eine Bindungslänge von 1.8118
Å verbunden. Dies wird durch die grün-markierte 1 ausgedrückt. Die 1 hinter der Bindungslängenangabe sagt MOPAC, dass diese Größe optimiert wird (0: wird nicht optimiert). Das erste O-Atom ist mit N1 durch die Länge 1.1718 Å verbunden und es bildet mit den beiden N-Atomen einen Bindungswinkel von 114.0853° (O3-N1-N2). Das zweite O-Atom ist mit N1 verbunden, bildet mit N1-N2 einen Winkel von 114.0875° und mit N1-N2-O3 einen Diederwinkel von 179.9999°, ist also praktisch planar (180°). Das dritte O-Atom ist mit N2 verbunden. Bindungswinkel: O5-N2-N1, Diederwinkel: O5-N2-N1-O3 = 0.0°.

ergibt:
YOUR FULLY SUBSTITUTED Z-MATRIX IS
N
N 1   1.8118000
O 1   1.1718000 2   114.0853
O 1   1.1719000 2   114.0875 3   179.9999 0
O 2   1.1719000 1   114.1060 3     0.0000 0
O 2   1.1719000 1   114.0973 3   179.9999 0
 

ATOM ATOMIC COORDINATES (BOHR)
CHARGE X Y Z
N 7.0   -1.7121033041   0.0001468835  0.0000000000
N 7.0    1.7117022348  -0.0000511769  0.0000000000
O 8.0   -2.6156668973   2.0217936524  0.0000000000
O 8.0   -2.6160555444  -2.0215331413  0.0000000000
O 8.0    2.6163072000   2.0213368690  0.0000000000
O 8.0    2.6157663660  -2.0216811683  0.0000000000
 

!
! Bicyclopropylium
!
!
$CONTRL SCFTYP=RHF MULT=1 ICHARG=+2 RUNTYP=OPTIMIZE COORD=ZMTMPC $END
$SYSTEM TIMLIM=100 MEMORY=4000000 $END
$BASIS GBASIS=STO NGAUSS=6 $END
$GUESS GUESS=HUCKEL $END
$DATA
Bicyclopropylium
C1
C   0.0000 0   000.0000 0   000.0000 0 0 0 0
C   1.4012 1   000.0000 0   000.0000 0 1 0 0
C   1.3935 1   149.5295 1   000.0000 0 2 1 0
C   1.3935 1   149.5295 1   179.9999 1 2 1 3
C   1.3935 1   149.5295 1   180.0000 1 1 2 3
C   1.3935 1   149.5295 1   000.0000 1 1 2 3
H   1.0958 1   150.3313 1   179.9999 1 3 2 4
H   1.0958 1   150.3314 1   179.9999 1 4 2 3
H   1.0958 1   150.3314 1   179.9999 1 5 1 6
H   1.0958 1   150.3314 1   180.0000 1 6 1 5
$END

 

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